Detection of multidrug-resistant Enterobacteriaceae isolated from river waters flowing to the Guanabara Bay and from clinical samples of hospitals in Rio de Janeiro, Brazil / Detección de enterobacterias multirresistentes aisladas en aguas de los ríos que desembocan en la bahía de Guanabara y en muestras de hospitales de Río de Janeiro, Brasil

Abstract Introduction: The use of antibiotics in humans, animal husbandry and veterinary activities induces selective pressure leading to the colonization and infection by resistant strains. Objective: We evaluated water samples collected from rivers of the Guanabara Bay, which have suffered minor and major environmental degradation, and clinical samples of hospital origin to detect evidence of the presence of resistance genes to aminoglycosides, beta-lactam antibiotics and fluoroquinolones in strains of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, K. pneumoniae subsp. ozaenae and Escherichia coli. Materials and methods: For isolation of the water strains we employed culture media containing 32 μg/ml cephalotin and 8 μg/ml gentamicin. The strains from clinical materials were selected using culture media containing 8 μg/ml gentamicin. The strains were identified and subjected to antimicrobial susceptibility testing (AST), plasmid DNA extraction and polymerase chain reaction (PCR) to detect genes encoding enzymes modifying aminoglycosides (EMA), extended-spectrum beta-lactamases (ESBL) and plasmid mechanisms of quinolone resistance (PMQR). Results: The AST of the isolates recovered from water samples showed multidrug-resistance profiles similar to those found in isolates recovered from clinical materials. All isolates from water samples and 90% of the isolates from clinical samples showed at least one plasmid band. In the PCR assays, 7.4% of the isolates recovered from water samples and 20% of those from clinical materials showed amplification products for the three antimicrobial classes. Conclusion: We believe that the detection of microorganisms presenting genetic elements in environments such as water is necessary for the prevention and control of their dissemination with potential to infect humans and other animals in eventual contact with these environments.

Resumen Introducción. El uso de antibióticos en seres humanos, en la industria pecuaria y en las actividades veterinarias induce una presión selectiva que resulta en la colonización e infección con cepas resistentes. Objetivo. Determinar la presencia de genes de resistencia a aminoglucósidos, betalactámicos y fluoroquinolonas en cepas de Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, K. pneumoniae subsp. ozaenae y Escherichia coli, obtenidas de muestras de agua de los ríos que desembocan en la bahía de Guanabara y de muestras clínicas de hospitales de Río de Janeiro. Materiales y métodos. En la selección de las cepas resistentes obtenidas de las muestras de agua de los ríos, se emplearon medios de cultivo que contenían 32 μg/ml de cefalotina y 8 μg/ ml de gentamicina. En el caso de las muestras de especímenes clínicos, se usaron medios de cultivo que contenían 8 μg/ml de gentamicina. Las cepas se identificaron y se sometieron a pruebas de sensibilidad antimicrobiana, extracción de ADN plasmídico y pruebas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para detectar los genes que codifican aquellas enzimas que modifican los aminoglucósidos, las betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y los mecanismos de resistencia a las quinolonas mediados por plásmidos. Resultados. Se encontraron perfiles de resistencia a los antimicrobianos similares en los dos grupos. En todas las bacterias obtenidas de las muestras de agua y en 90 % de las muestras clínicas, se evidenciaron bandas de plásmidos asociados con la transferencia de genes de resistencia. En las pruebas de PCR, se obtuvieron productos de amplificación de los genes de resistencia para las tres clases de antimicrobianos analizados, en el 7,4 % de las bacterias recuperadas de las muestras de agua y en el 20 % de aquellas recuperadas de las muestras clínicas. Conclusión. La detección de microorganismos con elementos genéticos que confieren resistencia a los antibióticos en ambientes como el agua, es una estrategia necesaria para prevenir y controlar la diseminación de estos agentes patógenos con potencial para infectar a humanos y a otros animales en dichos ambientes.

Influence of water level fluctuation on the mortality and aboveground biomass of the aquatic macrophyte Eleocharis interstincta (VAHL) roemer et schults

O objetivo deste trabalho foi verificar as alterações biométricas de Eleocharis interstincta em resposta às variações no nível da água da Lagoa de Cabiúnas, localizada na região norte do Estado do Rio de Janeiro, no município de Macaé (22o00' e 22o30' S, 41o30' e 42o00' O). Três quadrados de 0,0625 m2 foram coletados quinzenalmente de junho/1997 a junho/1998; as amostras separadas em caules, detritos e rizoma; medidas, secas e pesadas. O nível da água variou sazonalmente no estande das macrófitas, apresentando dois períodos de seca. O primeiro período ocorreu naturalmente, no final do inverno e início da primavera, quando a precipitação na região é menor. O segundo período de seca foi resultado da abertura artificial da barra de areia, que separa a lagoa do mar. A abertura da barra foi feita no verão, período de maior precipitação, quando o nível da água registrou o máximo valor durante o período de estudo (1,35 m). Foi encontrada uma forte correlação positiva entre o nível da água com o tamanho médio dos caules e a biomassa aérea, indicando que o nível da água desempenha um importante papel na determinação destes parâmetros. Houve uma diferença significativa no tamanho (ANOVA; p < 0.001) e biomassa aérea dos caules (ANOVA; p < 0.001) entre os períodos amostrais, variando de 143,9 cm e 338,8 g peso seco.m-2, antes da abertura, a 16,3 cm e 20.2 g peso seco.m-2 respectivamente depois da abertura da barra. A drástica variação no nível da água, ocasionando a mortalidade em massa dos caules, juntamente com a menor razão biomassa /caule (0.057 g de peso seco.individuo-1), registrados depois da abertura de barra, não representou um grande distúrbio para E. interstincta, visto que o tempo de resiliência para esta população foi estimado em 30 dias.

Methane concentration in water column and in pore water of a coastal lagoon (Cabiúnas lagoon, Macaé, RJ, Brazil)

O objetivo dessa pesquisa foi determinar a concentração de metano na coluna d'água e na água intersticial do sedimento nas regiões limnética e litorânea de uma lagoa costeira (Lagoa Cabiúnas, Macaé, RJ). Na região litorânea as amostras foram coletadas em três estandes de macrófitas (Typha domingensis, Eleocharis interstincta e Potamogeton stenostachys). A concentração de metano na água intersticial na região litorânea foi maior do que aquela encontrada na região limnética em cada fração do sedimento. A maior concentração de metano na fração superficial do sedimento (0-2 cm) foi observada no estande de P. stenostachys (3.7 mM). Este resultado foi o único significativamente diferente (p<0.05) da região limnética. A concentração de metano na água intersticial aumentou com a profundidade nos estandes de macrófitas. A concentração de metano na coluna d'água não variou significativamente entre os pontos de coleta (p>0.05). Os resultados sugerem que há uma considerável influência das macrófitas aquáticas estudadas na concentração de metano na água intersticial do sedimento.

Natural diet of three species of shrimp in a tropical coastal lagoon

The gut content of 495 specimens of Farfantepenaeus brasiliensis, 131 of F. paulensis (Penaeidae) and 102 of Macrobrachium acanthurus (Palaemonidae) were analyzed to establish the composition of their diets F. brasiliensis had as the most important feeding items in its diet larvae of Chironomidae, Polychaeta and Heleobia australis (Mollusca). For F. paulensis, the most important items were the same as for F. brasiliensis, but the order of importance of H. australis and Polychaeta was inverted. M. acanthurus had detritus as the most important item, followed by Chironomidae larvae, Odonata nymphs, and fragments of the macroalgae Chara. The results showed that the three species were omnivorous, with a varied diet including both components of macrofauna of benthos and associated to the macroalgae Chara and plant fragments and detritus

Ecological aspects of the antimicrobial resistance in bacteria of importance to human infections

In view of the intimate relationship of humans with coastal lagoons (used for recreation, tourism, water supply, etc.), the discharge of domestic effluents may lead to the establishment of routes of dissemination of pathogenic microorganisms, including microorganisms carrying genes for resistance to antimicrobials, through the surrounding human communities. The objective of the present investigation was to relate the presence of antimicrobial-resistant bacteria to the environmental characteristics of three coastal lagoons, comparing the results with those from hospital sewage. Of the lagoons evaluated, two (Geriba and Imboassica) receive domestic sewage discharge, and the other (Cabiunas) is still in a natural state. We isolated in a culture medium containing 32 1/4ìg/ml of Cephalothin, fecal coliforms (E. coli), non-fecal coliforms (Klebsiella, Enterobacter, Serratia, and Citrobacter), non-glucose-fermenting Gram-negative bacilli, and Aeromonas sp. In cultures from the hospital drain we found strains showing numerous markers for resistance to most of the 11 antimicrobials tested. On the other hand, in cultures from Cabiunas and Imboassica lagoons, we found strains showing resistance only to antibiotics frequently observed in non-selective situations (considered as "common" markers). The capacity for dilution in the ecosystem, and salinity appeared related with the occurrence of multi-resistant bacterial strains. The intensity of recent fecal contamination was not shown to be associated with the numbers and types of markers found.